Поиск
Главная >CancerPrecision®

CancerPrecision®

Комплексное профилирование опухолей

Алгоритмы принятия клинических решений в онкологии все больше зависят от уникальных молекулярных особенностей заболевания и не могут быть реализованы без полноценной молекулярной диагностики. Опухоль каждого пациента уникальна, универсальной терапии не существует. Комплексное геномное профилирование опухолевой ткани помогает выявлять клинически значимые мутации в генах, непосредственно ассоциированных с развитием злокачественного новообразования, и предоставляет ценную информацию для выбора наиболее эффективной индивидуальной схемы лечения.

CancerPrecision® предоставляет оптимальный молекулярно-генетический анализ опухолевой ткани с использованием NGS и лежит в основе персонализированной терапии злокачественных новообразований на основе выявленных биомаркеров.

Опциональный анализ РНК-слияний (CancerFusionRx®) также позволяет обнаруживать транскрипты более чем 150 генов.

По результатам исследования формируется подробный медицинский отчет, содержащий результаты генетического тестирования, запрошенного вами как лечащим врачом. Каждый медицинский отчет готовится и обсуждается междисциплинарной командой молекулярных биологов и врачей для обеспечения наивысшего качества.

    Подробнее о диагностике:

  • Полное секвенирование и анализ более чем 700 генов, ассоциированных с опухолями, и транслокаций в более чем 30 генах
  • Секвенирование и сравнительный анализ нормальной и опухолевой тканей
  • Высокое покрытие секвенирования (500-1000x) позволяет обнаруживать терапевтически значимые варианты в субклонах
  • Чувствительность: более 96%; Специфичность: более 99,9%
  • Анализ опухолевой мутационной нагрузки (TMB), микросателлитной нестабильности (MSI) и вирусных инфекций (в том числе HPV, EBV)
  • Оценка дефицита гомологичной рекомбинации (HRD) — важного биомаркера для оценки эффективности лечения ингибиторами PARP
  • Анализ однонуклеотидных вариантов (SNV), инсерций и делеций (Indels), транслокаций и вариаций числа копий (CNV)
  • Помимо терапевтически значимых соматических (специфичных для опухоли) мутаций также предоставляется информация о патогенных и терапевтически значимых герминальных вариантах
  • Выборочное определение герминальных фармакогенетически значимых вариантов, критически важных для индивидуализированной коррекции дозировок лекарственных средств для ваших пациентов
  • Список всех подходящих лекарств, имеющих одобрение EMA и/или FDA, для которых обнаружены биомаркеры в опухоли
  • Выявление мозаичных вариантов: CHIP - клональный гемопоэз неопределенного потенциала

    Сравнение опухолевой и нормальной ткани

    Единственный точный метод для выявления соматических вариантов
  • Параллельное секвенирование здоровой и опухолевой тканей позволяет различать соматические варианты, характерные для опухолевой ткани, и герминальные варианты, присутствующие также в здоровой ткани
  • Обеспечивает точный расчет опухолевой мутационной нагрузки (TMB)
image

Прогнозирование микросателлитной нестабильности (MSI)

Основа для принятия решений по иммунотерапии с использованием ингибиторов контрольных точек

В CeGaT мы применяем методы NGS для предсказания статуса MSI, что позволяет провести анализ с высокой точностью и специфичностью. Этот подход был подтвержден анализом сотен пар нормальных и опухолевых образцов различных видов рака, включая тестирование более 2500 целевых микросателлитных локусов. Это позволяет нам не только точно определять статус MSI, но и обеспечивать более информативное и надежное основание для выбора стратегии лечения, основанного на иммунотерапии

CancerPrecision

Анализ HRD – дефицита гомологичной рекомбинации

Важный биомаркера для оценки эффективности лечения ингибиторами PARP

Мутации в генах, участвующих в гомологичной рекомбинации, могут повысить чувствительность опухоли к ингибиторам PARP и химиотерапии на основе платины. Точное определение статуса HRD в опухолях критически важно для принятия решения о применении данных препаратов, с целью обеспечения таргетной терапии, направленной на механизмы уязвимости раковых клеток.

Анализ вариаций числа копий (CNV)

Идентификация регионов делеций/амплификаций для достижения максимальной терапевтической эффективности

В опухолях регулярно встречаются изменения числа копий генов в результате общей геномной нестабильности. В этих случаях наблюдается делеция или амплификация крупных участков хромосом. Понимание последствий делеции/амплификации и функционального значения генов в затронутом регионе необходимо для принятия решения об оптимальной терапии.

Идентифицированные делеции и амплификации в генах, имеющих известную терапевтическую значимость, выносятся в начало отчета. Полный CNV-профиль CNV представлен в приложении к отчету.

CancerPrecision

CancerFusionRx® - идентификация гибридных РНК-транскриптов

Хромосомные перестройки характерны для всех типов рака, являются основными драйверами развития опухоли и имеют крайне важное значение для принятия решений о выборе тактики лечения. Традиционные методы диагностики на основе ПЦР не позволяют обнаружить регионы перестроек, если неизвестны оба гена-участника. Зачастую, даже полнотранскриптомный анализ не обладает достаточной чувствительностью, особенно при низкой концентрации опухолевых клеток.

Для обнаружения всех известных, ранее описанных перестроек, а также для идентификации новообразованных химерных генов, имеющих терапевтическое значение, команда CeGaT разработала систему обогащения, таргетирующую РНК. В настоящее время система включает в себя более 150 генов для идентификации регионов слияний и более 120 экзон-специфических зон обогащений с описанными точками разрыва. Этот метод значительно превосходит традиционные методы исследования на основе определения ДНК, а также исследования тотальной РНК. Специалисты CeGaT настоятельно рекомендуют дополнять генетическую диагностику опухоли РНК-таргетирующей системой обнаружения генных перестроек для максимально полного изучения биологии опухоли.

CancerPrecisionCancerPrecision

Почему мы

Скорость

Отчет через 2-4 недели после получения образца

Безопасность

Высочайшие стандарты конфиденциальности и качества

Надежность

Надежная поддержка на всех этапах

Прозрачность

Понятно подготовленное медицинское заключение

Материал

 

Здоровая ткань: 

  • 1-2 мл крови, собранные в пробирки с ЭДТА

 

Опухолевая ткань:

  • Парафиновый блок (FFPE), минимальный размер ткани 5x5x5 мм, содержание опухолевых клеток не менее 20% (рекомендуемый тип образца) или
  • Срезы опухолевой ткани FFPE (мин. 10 срезов 4−10 мкм, размер ткани 5×5 мм) или
  • Свежезамороженная опухолевая ткань или
  • 3 x 10 мл крови, собранные в cfDNA пробирки для жидкостной биопсии

Диагностический процесс

Вы можете ознакомиться со всем процессом диагностики здесь

Консультирование и выбор теста

Отбор проб

Анализ образцов

Медицинское заключение и консультация

Медицинский отчет

Полученные результаты группируются по основным категориям и представляются в виде блоков:

 

  • Содержание опухолевых клеток
  • Мутационная нагрузка опухоли (TMB)
  • Микросателлитная нестабильность (MSI)
  • Оценка дефицита гомологичной рекомбинации (HRD)
  • Структурные варианты
  • Драйверные мутации опухоли
  • Вирусные инфекции (HPV, EBV)
  • Наследственные варианты
  • Варианты, значимые для метаболизма лекарств
  • Потенциальный клональный гемопоэз неопределенного потенциала (CHIP)

 

 

Выявление вариантов с потенциальной терапевтической значимостью включает:

  • Подробное описание соматических изменений для каждого гена
  • Указание терапевтических опций с учетом одобрения EMA/FDA
  • Расширенный список возможных терапевтических стратегий в приложении

Наборы генов

CancerPrecision®

TUM01

ABCB1, ABCG2, ABL1, ABL2, ABRAXAS1, ACD, ACVR1, ACVR2A, ADGRA2, ADRB1, ADRB2, AIP, AIRE, AJUBA, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ALOX12B, AMER1, ANKRD26, APC, APLNR, APOBEC3A, APOBEC3B, AR, ARAF, ARFRP1, ARHGAP35, ARID1A, ARID1B, ARID2, ARID5B, ASXL1, ASXL2, ATM, ATR, ATRX, AURKA, AURKB, AURKC, AXIN1, AXIN2, AXL, B2M, B4GALNT1, BAP1, BARD1, BAX, BCHE, BCL10, BCL11A, BCL11B, BCL2, BCL2L1, BCL2L11, BCL3, BCL6, BCL9, BCOR, BCORL1, BCR, BIRC2, BIRC3, BIRC5, BLM, BMI1, BMPR1A, BRAF, BRCA1, BRCA2, BRD3, BRD4, BRD7, BRIP1, BTK, BTN3A1, BUB1B, CACNA1S, CALR, CARD11, CASP8, CBFB, CBL, CBLB, CBLC, CCDC6, CCND1, CCND2, CCND3, CCNE1, CD274, CD276, CD70, CD79A, CD79B, CD82, CDC42, CDC73, CDH1, CDH11, CDH2, CDH3, CDH5, CDK1, CDK12, CDK2, CDK4, CDK5, CDK6, CDK8, CDKN1A, CDKN1B, CDKN1C, CDKN2A, CDKN2B, CDKN2C, CEACAM5, CEBPA, CENPA, CEP57, CFTR, CHD1, CHD2, CHD4, CHEK1, CHEK2, CIC, CIITA, CLDN18, CNKSR1, COL1A1, COMT, COQ2, CREB1, CREBBP, CRKL, CRLF2, CRTC1, CSF1R, CSF3R, CSMD1, CSNK1A1, CTAG1B, CTCF, CTLA4, CTNNA1, CTNNB1, CTR9, CTRC, CUL3, CUX1, CXCR4, CYLD, CYP1A2, CYP2A7, CYP2B6, CYP2C19, CYP2C8, CYP2C9, CYP2D6, CYP3A4, CYP3A5, CYP4F2, DAXX, DCC, DDB2, DDR1, DDR2, DDX11, DDX3X, DDX41, DHFR, DICER1, DIS3L2, DLL3, DNMT1, DNMT3A, DOT1L, DPYD, E2F3, EED, EFL1, EGFR, EGLN1, EGLN2, EIF1AX, ELAC2, ELF3, EME1, EML4, EMSY, EP300, EPAS1, EPCAM, EPHA2, EPHA3, EPHB4, EPHB6, ERBB2, ERBB3, ERBB4, ERCC1, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERG, ERRFI1, ESR1, ESR2, ETNK1, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EXO1, EXT1, EXT2, EZH1, EZH2, EZHIP, F3, FAN1, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, FANCM, FAS, FAT1, FBXO11, FBXW7, FEN1, FES, FGF10, FGF14, FGF19, FGF2, FGF23, FGF3, FGF4, FGF5, FGF6, FGF9, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FGFR4, FH, FLCN, FLI1, FLT1, FLT3, FLT4, FOLH1, FOLR1, FOXA1, FOXE1, FOXL2, FOXO1, FOXQ1, FRK, FRS2, FUS, FYN, G6PD, GALNT12, GATA1, GATA2, GATA3, GATA4, GATA6, GGT1, GLI1, GLI2, GLI3, GNA11, GNA13, GNAQ, GNAS, GNB3, GPC3, GPER1, GREM1, GRIN2A, GRM3, GSK3A, GSK3B, GSTP1, H3-3A, H3-3B, H3C1, H3C2, H3C3, HABP2, HAVCR2, HCK, HDAC1, HDAC2, HDAC6, HGF, HIF1A, HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DPA1, HLA-DPB1, HLA-DQA1, HLA-DQB1, HLA-DRA, HLA-DRB1, HMGA2, HMGCR, HMGN1, HNF1A, HNF1B, HOXB13, HRAS, HSD3B1, HSP90AA1, HSP90AB1, HTR2A, ICOSLG, ID2, ID3, IDH1, IDH2, IDO1, IFNGR1, IFNGR2, IFNL3, IGF1, IGF1R, IGF2, IGF2R, IKBKB, IKBKE, IKZF1, IKZF3, IL1B, IL1RN, IL7R, INPP4A, INPP4B, INPPL1, INSR, IRF1, IRF2, IRS1, IRS2, IRS4, ITPA, JAK1, JAK2, JAK3, JUN, KAT6A, KDM5A, KDM5C, KDM6A, KDR, KEAP1, KIAA1549, KIF1B, KIT, KLF2, KLF4, KLHL6, KLLN, KMT2A, KMT2B, KMT2C, KMT2D, KRAS, KSR1, LAG3, LAMP1, LATS1, LATS2, LCK, LIG4, LIMK2, LRP1B, LRRK2, LTK, LYN, LZTR1, MAD2L2, MAF, MAGEA1, MAGEA12, MAGEA3, MAGEA4, MAGEA8, MAGI1, MAGI2, MAML1, MAP2K1, MAP2K2, MAP2K3, MAP2K4, MAP2K5, MAP2K6, MAP2K7, MAP3K1, MAP3K13, MAP3K14, MAP3K3, MAP3K4, MAP3K6, MAP3K8, MAPK1, MAPK11, MAPK12, MAPK14, MAPK3, MAX, MBD4, MC1R, MCL1, MDC1, MDH2, MDM2, MDM4, MECOM, MED12, MEF2B, MEN1, MERTK, MET, MGA, MGMT, MITF, MLH1, MLH3, MLLT10, MLLT3, MMP2, MMS22L, MN1, MPL, MRE11, MS4A1, MSH2, MSH3, MSH4, MSH5, MSH6, MSLN, MSR1, MST1R, MTAP, MTHFR, MTOR, MT-RNR1, MTRR, MUC1, MUTYH, MXI1, MYB, MYC, MYCL, MYCN, MYD88, MYH11, MYH9, MYOD1, NAT2, NBN, NCOA1, NCOA3, NCOR1, NF1, NF2, NFE2L2, NFKB1, NFKB2, NFKBIA, NFKBIE, NIN, NKX2-1, NLRC5, NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3, NOTCH4, NPM1, NQO1, NR1I3, NRAS, NRG1, NSD1, NSD2, NSD3, NT5C2, NTHL1, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUDT15, NUMA1, NUP98, NUTM1, OBSCN, OPRM1, PAK1, PAK3, PAK4, PAK5, PALB2, PALLD, PARP1, PARP2, PARP4, PAX3, PAX5, PAX7, PBK, PBRM1, PBX1, PDCD1, PDCD1LG2, PDGFA, PDGFB, PDGFC, PDGFD, PDGFRA, PDGFRB, PDK1, PDPK1, PGR, PHF6, PHOX2B, PIAS4, PIGA, PIK3C2A, PIK3C2B, PIK3C2G, PIK3CA, PIK3CB, PIK3CD, PIK3CG, PIK3R1, PIK3R2, PIK3R3, PIM1, PLCG1, PLCG2, PLK1, PMEL, PML, PMS1, PMS2, POLB, POLD1, POLE, POLH, POLQ, POR, POT1, PPARG, PPM1D, PPP2R1A, PPP2R2A, PRAME, PREX2, PRKAR1A, PRKCA, PRKCI, PRKDC, PRKN, PRMT5, PRR4, PSMB1, PSMB10, PSMB2, PSMB5, PSMB8, PSMB9, PSMC3IP, PSME1, PSME2, PSME3, PTCH1, PTCH2, PTEN, PTGS2, PTK2, PTK7, PTPN11, PTPN12, PTPRC, PTPRD, PTPRS, PTPRT, RABL3, RAC1, RAC2, RAD21, RAD50, RAD51, RAD51B, RAD51C, RAD51D, RAD54B, RAD54L, RAF1, RALGDS, RARA, RASA1, RASAL1, RB1, RBM10, RECQL4, REST, RET, RFWD3, RFX5, RFXANK, RFXAP, RHBDF2, RHEB, RHOA, RICTOR, RIF1, RINT1, RIPK1, RIT1, RNASEL, RNF43, ROS1, RPS20, RPS6KB1, RPS6KB2, RPTOR, RSF1, RSPO1, RSPO2, RSPO3, RSPO4, RUNX1, RYR1, SAMHD1, SAV1, SBDS, SCG5, SDHA, SDHAF2, SDHB, SDHC, SDHD, SEC23B, SERPINB9, SETBP1, SETD2, SETDB1, SF3B1, SGK1, SH2B3, SHH, SHLD2, SIK2, SKP2, SLC19A1, SLC26A3, SLC45A2, SLCO1B1, SLFN11, SLIT2, SLX4, SMAD3, SMAD4, SMARCA2, SMARCA4, SMARCB1, SMARCE1, SMC1A, SMC3, SMO, SOCS1, SOS1, SOX11, SOX2, SOX9, SPEN, SPINK1, SPOP, SPRED1, SRC, SRD5A2, SRGAP1, SRSF2, SSTR2, SSX1, STAG2, STAT1, STAT3, STAT5A, STAT5B, STK11, SUCLG2, SUFU, SUZ12, SYK, TACSTD2, TAF1, TAF15, TAP1, TAP2, TAPBP, TBK1, TBX3, TCF3, TCF4, TCL1A, TEK, TERC, TERF2IP, TERT, TET1, TET2, TFE3, TGFB1, TGFBR2, TMEM127, TMPRSS2, TNFAIP3, TNFRSF13B, TNFRSF14, TNFRSF8, TNFSF11, TOP1, TOP2A, TP53, TP53BP1, TP63, TPMT, TPX2, TRAF2, TRAF3, TRAF5, TRAF7, TRIM28, TRRAP, TSC1, TSC2, TSHR, TTK, TYMS, U2AF1, UBE2T, UBR5, UGT1A1, UGT2B15, UGT2B7, UIMC1, USP9X, VEGFA, VEGFB, VHL, VKORC1, VTCN1, WRN, WT1, XIAP, XPA, XPC, XPO1, XRCC1, XRCC2, XRCC3, XRCC5, XRCC6, YAP1, YES1, ZFHX3, ZNF217, ZNF703, ZNRF3, ZRSR2

Заказать сейчасЗаказать сейчас

CancerFusionRx®

STR01. Опциональный анализ РНК-слияний, позволяет обнаруживать транскрипты более чем 150 генов

ABL1, ACTB, AFAP1, AGK, AKAP4, AKAP9, AKAP12, AKT1, AKT2, AKT3, ALK, ARHGAP6, ARHGAP26, ASPL, ASPSCR1, ATF1, ATP1B1, ATRX, AVIL, AXL, BAG4, BCL2, BCOR, BCORL1, BCR, BEND2, BICC1, BRAF, BRD3, BRD4, c11orf95, CAMTA1, CCAR2, CCDC6, CCDC88A, CCDC170, CCNB3, CCND1, CD44, CD74, CEP85L, CIC, CLDN18, CLIP1, CLTC, CNTRL, COL1A1, CREB1, CREB3L1, CREB3L2, CRTC1, CTNNB1, DDIT3, DNAJB1, EGFR, EML4, EPC1, EPCAM, ERBB2, ERBB4, ERG, ESR1, ESRRA, ETV1, ETV4, ETV5, ETV6, EWSR1, EZR, FEV, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FLI1, FN1, FOXO1, FOXO4, FOXR2, FUS, GLI1, GOPC, GPR128, HEY1, HMGA2, HTRA1, IGF1R, INSR, JAK2, JAZF1, KIAA1549, KIF5B, KIT, LEUTX, LMNA, LPP, LTK, MAGI3, MAML1, MAML2, MAML3, MAMLD1, MAP3K8, MARS1, MAST1, MAST2, MEAF6, MET, MGA, MGMT, MITF, MKL2, MN1, MSH2, MYB, MYBL1, MYC, NAB2, NCOA1, NCOA2, NCOA3, NCOA4, NFATC2, NFIB, NOTCH2, NPM1, NR4A3, NRG1, NRG2, NSD3, NTRK1, NTRK2, NTRK3, NUTM1, PAX3, PAX7, PAX8, PBX1, PDGFB, PDGFD, PDGFRA, PDGFRB, PHF1, PIK3CA, PLAG1, PML, POU5F1, PPARG, PPARGC1A, PPP1CB, PRKACA, PRKAR1A, PRKCA, PRKCB, PRKD1, PRKD2, PRKD3, PTPRZ1, QKI, RAD51B, RAF1, RANBP2, RARA, RELA, RELCH, RET, ROS1, RPS6KB1, RREB1, RSPO2, RSPO3, SDC1, SDC4, SH3PXD2A, SLC1A2, SHTN1, SLC34A2, SLC44A1, SLC45A3, SND1, SQSTM1, SS18, SSX1, SSX2, SSX4, STAT6, STRN, SUZ12, TACC1, TACC2, TACC3, TAF2N, TAF15, TCF3, TCF12, TERT, TFE3, TFEB, TFG, THADA, TMPRSS2, TPM3, TPR, TRIM24, TRIM33, TRIO, TTYH1, VGLL2, VGLL3, VMP1, WT1, WWTR1, YAP1, YWHAE, ZC3H7B, ZMYM2, ZNF703

Заказать сейчасЗаказать сейчас

Дополнительные услуги

Дополнительный образец для CancerPrecision®

TUM01AS

ИГХ-исследования

IHC_PDL1 - PD-L1; IHC_MHC12 - MHCI/MHCII; IHC_CART - CAR T Cell Panel

CancerAdvise - детализированная рекомендация по терапии

TBR. На основании информации, полученной в результате секвенирования, команда CeGaT оценивает каждый случай индивидуально и предлагает наиболее перспективную терапию по последним литературным данным. В случае отсутствия утвержденных показаний к применению препаратов, мы предоставляем подробную информацию о последних клинических исследованиях, ассоциированных биомаркерах, лекарственных препаратах, дозировках и полученных результатах. Отчет с перечнем текущих клинических испытаний соответствующих таргетных препаратов формируется на основе данных, полученных из пяти стран.

Метилирование промотора MLH1 или MGMT

Дополнения

Иконка

CeGaT_TumorDiagnostics_Brochure

Загрузить

Связаться с нами

email

email

info@medseq.ru

phone
Телефон

+7 (880) 023-42-11

address

117405, г. Москва, Варшавское ш., д. 141 к. 6